Dúvidas na função tbl_summary

Caros,

Estou usando os comandos abaixo e gostaria de acrescentar uma coluna de total na minha tabela. Alguém poderia me ajudar?

  • tab1 <- dados_internacao %>% select(Sexo,Raca, Tumor, Tratamento3,Estadiamento,Classif_SI_2) set.seed(42) tab1 %>% gtsummary::tbl_summary(data = ., by = Classif_SI_2) %>% gtsummary::add_p(x = ., test = everything() ~ “chisq.mc.test”)

obrigada

Não achei nenhum jeito oficial tbm. Fiz uma gambiarra monstra aqui criando uma coluna constante no banco de dados e chamando de Total.
Você não precisaria de teste p neh? As contagens do cabeçalho talvez dê para colocar porcentagem tbm, daí serviria como um total, mas não encontrei.

library(gtsummary)
    library(tidyverse)
    dados_internacao <- tibble(
        Sexo = sample(c("Masc", "Fem"), size = 100, replace = TRUE),
        Raca = sample(c("Branca", "Parda", "Preta"), size = 100, replace = TRUE),
        Tumor = sample(c("bexiga+rim", "cabeça+tireoide"), size = 100, replace = TRUE),
        Total = "Total",
        Classif_SI_2 = sample(c("Ausente", "Presente"), size = 100, replace = TRUE)
    )
    
    tab1 <- dados_internacao %>% 
        select(Sexo,Raca, Tumor, Total, Classif_SI_2) 
    
    set.seed(42) 
    
    tab1 %>% 
        gtsummary::tbl_summary(by = Classif_SI_2) %>%
        gtsummary::add_p(test = everything() ~ "chisq.test")
#> There was an error in 'add_p()' for variable 'Total' and test 'chisq.test', p-value omitted:
#> Error in stats::chisq.test(data[[variable]], as.factor(data[[by]])): 'x' and 'y' must have at least 2 levels

Characteristic

Ausente, N = 451

Presente, N = 551

p-value2

Sexo

0.4

Fem

24 (53%)

24 (44%)

Masc

21 (47%)

31 (56%)

Raca

0.6

Branca

17 (38%)

16 (29%)

Parda

17 (38%)

21 (38%)

Preta

11 (24%)

18 (33%)

Tumor

0.8

bexiga+rim

24 (53%)

27 (49%)

cabeça+tireoide

21 (47%)

28 (51%)

Total

Total

45 (100%)

55 (100%)

1

Statistics presented: n (%)

2

Statistical tests performed: chi-square test of independence

Created on 2020-05-22 by the reprex package (v0.3.0)

Athos, eu preciso da soma na linha… então, teria mais uma coluna, antes do p, com os totais e %s.
obrigada

ah, sim! nesse caso tem o gtsummary::add_n()

acho que é isso que vocẽ precisa!