A pergunta é como usar esses demos como base para aprendizado ou layout?
Outro exemplo bacana é “Story’s theme with apron & al” que naveguei na mesma página. Na apresentação ele tem esse slide que mostra possíveis layouts definidos através de classe. Como funciona?
Sobre usar JS externos nos slides: o pacote xaringanExtra faz isso em vários das suas extensões para xaringan. Olhando o código dá pra ver que os arquivos externos JS são “chamados” usando a função htmltools::htmlDependency()